Este Pueblo Mágico posee la joya del churrigueresco mexicano: El Museo Nacional del Virreinato, contruido en 1580 como el Colegio Jesuita de San Francisco Javier. Destacan por su riqueza el altar principal de la capilla, la iglesia de San Francisco Javier y la iglesia de San Pedro Apóstol de estilo neoclásico, sin olvidar la importante colección museográfica al interior. No se te vaya a pasar la vista desde su mirador. Muy cerca del museo no se te pase visitar el imponente Acueducto de Tepotzotlán que cuenta con cuarenta y tres arcos y 438 metros de altura.

En 1460 se fundó el señorío de Tepotzotlán por Quinantzin III, y tuvo guerras constantes con los tecpanecas de Azcapotzalco bajo el mando de Tezozomo. En 1520 los españoles llegaron a esta región de otomíes que era gobernado por Macuilxochitzin quien al negarles hospitalidad, fue tomada por Cortés a la fuerza y su gobernante fue el Señor de Tenayucan. Desayuna unas ricas quesadillas de hongos, flor de calabaza y bebe un tequila en un jarrito con piña y chile piquín en el mercado municipal. Lleva a casa un escultura de ocotal,un trabajo de repujado o un hermosos bordado elaborado por las otomíes de la Plaza de las Artesanías. Tepotzotlán es un sitio muy tranquilo que aún guarda ese toque de provincia y hogar de joyas del arte novohispano.

Se incorporó al programa Pueblos Mágicos en el año 2002.